Em março de 2007 os missionários da Comunidade Católica Divino Oleiro chegaram para auxiliar nas atividades da Paróquia Santa Luzia e se estabeleceram em Muquém, sede do município. 

Três anos depois, no dia 28 de março de 2010, foi criada a Quase Paróquia de São Francisco de Assis e colocada sob os cuidados dos missionários do Divino Oleiro. Durante nove anos dedicaram-se à evangelização e assistência religiosa das comunidades. Em 2017, atendendo aos apelos de Missão em outros rincões do país e do mundo, encerraram a sua presença na Diocese. 

A Quase-Paróquia então foi confiada à Igreja Irmã de Florianó-polis que enviou padres e missionários para atender ao povo de Deus nessa região. Passaram por lá o Pe. Antonio Schmidt (2017-2018) e o Pe. Gercino Piazza (2019-2020). Dotaram a quase paróquia de uma mínima estrutura: casa paroquial, início da construção de uma nova igreja matriz e um centro comunitário com um grande terreno. 

Desde fevereiro de 2021 o Pe. Advar Francisco Morais assumiu o cuidado pastoral da Quase-Paróquia de São Francisco de Assis, em Muquém do S. Francisco. 

Atualmente, lá trabalha o Pe. Jefferson Luiz Alves da Silva, assumindo a Quase Paróquia em 04 de maio de 2024. A Quase Paróquia São Francisco de Assis ficou responsável por atender as comunidades que estão à esquerda da BR 242. São 19 Comunidades.