O arraial do Senhor do Bonfim e Bom Jesus de Chique-Chique foi elevado a categoria de Vila, em 06 de julho de 1832, desmembrada do município de Jacobina. Em 23 de outubro de 1834 finalmente é instalado o Município de Senhor do Bonfim de Xiquexique. 

Em 1875 foi erigida a paróquia, ainda pela Arquidiocese de São Salvador. Em 1913 com a criação da Diocese de Barra, a Paróquia Senhor do Bonfim passa à jurisdição de Dom Augusto Álvaro da Silva. O primeiro pároco residente foi Pe. Bernardino. Monsenhor Costa fundou em 26 de junho de 1926 o Apostolado da Oração e em 1928 a Pia União das Filhas de Maria. 

Pela Lei Estadual nº 2.082, de 13 de junho de 1928, a vila foi elevada à cidade. Pouco a pouco, novas freguesias foram surgindo e capelas foram sendo construídas: Nossa Senhora do Amparo (Saco dos Bois), São José, Utinga, Gameleira, Nossa Senhora da Glória e outras mais. 

Em 1932 houve uma grande missão animada pelos missionários redentoristas. Vieram depois Pe. Heitor de Araújo (1936-1937), Padres Arnaldo e Campos (1937-1941), Pe. José Bastos (1941-1955), Pe. Francisco Antunes (1956-1961), Pe. Mário Guedes (1961-1969), Pe. Jaime Boes (1969-1974), Pe. Evandro Ruiz Costa (1974-1981), Pe. Cristiano Mellinsem (1981-1985), Pe. Silvestre Koepp (1985-1989). 

Os frades capuchinhos chegara em 1989 e permaneceram até 2006: Frei Justo Venture, Frei Carlos Alberto, Frei José Genilton, Frei Evilson Souza, Frei Anailton Brito dos Santos e Frei Samuel Teles Lobo. Em 1991 organizaram as Santas Missões Populares. Frei Justo construiu um Centro de Formação para menores. 

Diversas comunidades religiosas se instalaram: as irmãs da Santíssima Eucaristia (1970), as irmãs Salvatorianas (1978), os frades Capuchinhos (1989), as irmãs Murialdinas (2002) que hoje conduzem o Centro de Formação Frei Justo Venture. Foram-se aos poucos organizando as pastorais.

De 2006 a 2008, padre Marcelo da Conceição Souza administrou a paróquia. De 2008 a 2015 a paróquia esteve aos sob os cuidados de Padre Elcio Inácio e Padre José Romero Freitas Cabral. 

Em 2013 sob a coordenação da Ir. Evanir Brugali surgiu o Curso de Teologia para leigo. A CPT tem estado presente na resistência das famílias camponesas diante do processo de ocupação das terras e implantação do mega projeto de irrigação dos Baixios de Irecê.

No dia 23 de agosto de 2016 o Pe. Claudio assumiu a Paróquia. Atualmente atende a 52 comunidades. Em 14 de julho de 2024, assume o Pe. Antônio Pereira de Souza como pároco desta Paróquia.